Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP36Q9P275 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP36Q9P275 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP36Q9P275 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP36Q9P275 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms