Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC50.07■■■■■ 5.61
CCDC180Q9P1Z9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC50.06■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC50.06■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC50.05■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC50.04■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC50.04■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.02■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.02■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC50.02■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC50■■■■■ 5.6
CCDC180Q9P1Z9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC49.99■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC49.99■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC49.99■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC49.98■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.97■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.97■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC49.96■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC49.95■■■■■ 5.59
CCDC180Q9P1Z9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC49.94■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC49.93■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC49.89■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.88■■■■■ 5.58
CCDC180Q9P1Z9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.86■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC49.86■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC49.84■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC49.84■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
CCDC180Q9P1Z9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC49.81■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC49.8■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC49.79■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC49.77■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC49.76■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC49.76■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.56
CCDC180Q9P1Z9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC49.74■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC49.74■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
CCDC180Q9P1Z9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.73■■■■■ 5.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms