Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PKD2L1Q9P0L9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PKD2L1Q9P0L9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L1Q9P0L9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms