Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBAP1Q9NZ09 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBAP1Q9NZ09 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBAP1Q9NZ09 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms