Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC10Q9NYD6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC10Q9NYD6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXC10Q9NYD6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXC10Q9NYD6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXC10Q9NYD6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXC10Q9NYD6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXC10Q9NYD6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms