Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ALKBH4Q9NXW9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ALKBH4Q9NXW9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms