Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PGPEP1Q9NXJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms