Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHP2Q9NX24 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHP2Q9NX24 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NHP2Q9NX24 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms