Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ASF1BQ9NVP2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ASF1BQ9NVP2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ASF1BQ9NVP2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ASF1BQ9NVP2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms