Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIC8BQ9NVN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RIC8BQ9NVN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIC8BQ9NVN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms