Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC38A7Q9NVC3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC38A7Q9NVC3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC38A7Q9NVC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC38A7Q9NVC3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms