Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDFIP2Q9NV92 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDFIP2Q9NV92 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDFIP2Q9NV92 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms