Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GKN1Q9NS71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GKN1Q9NS71 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GKN1Q9NS71 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms