Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
KCNIP2Q9NS61 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KCNIP2Q9NS61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms