Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCDHB16Q9NRJ7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PCDHB16Q9NRJ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCDHB16Q9NRJ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms