Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCL28Q9NRJ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms