Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRAC1Q9NRG0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRAC1Q9NRG0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRAC1Q9NRG0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms