Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf4Q9NR00 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf4Q9NR00 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C8orf4Q9NR00 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C8orf4Q9NR00 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms