Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 RAP1GAP-210ENST00000482984 331 ntTSL 55.65□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 34.8
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.028e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-211ENST00000591650 1437 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-207ENST00000589369 618 ntTSL 313.27□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 211.69□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 210.38□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 AP3D1-205ENST00000586370 911 ntTSL 25.64□□□□□ -1.518e-8■■■■■ 34.6
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 212.11□□□□□ -0.473e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.533e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.713e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-215ENST00000427487 924 ntTSL 510.12□□□□□ -0.793e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-202ENST00000373292 3297 ntTSL 59.46□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 HDLBP-225ENST00000452931 801 ntTSL 57.11□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.713e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.733e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 CSPP1-202ENST00000519163 3982 ntTSL 22.91□□□□□ -1.943e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 PDS5B-208ENST00000493653 972 ntTSL 1 (best)9.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 PDS5B-204ENST00000466078 1889 ntTSL 23.69□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 411.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 311.28□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 BRD7-204ENST00000475877 671 ntTSL 37.38□□□□□ -1.237e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 FRG1-207ENST00000533157 714 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 FRG1-205ENST00000524583 755 ntTSL 57.09□□□□□ -1.273e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 FRG1-204ENST00000514482 838 ntTSL 36.12□□□□□ -1.433e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 FRG1-206ENST00000531991 738 ntTSL 55.4□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 34.5
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 414.68□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 210.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-212ENST00000483451 1119 ntTSL 515.82■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 514.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-211ENST00000481136 674 ntTSL 28.86□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-217ENST00000494502 757 ntTSL 57.32□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-209ENST00000475915 849 ntTSL 55.15□□□□□ -1.594e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-215ENST00000492139 686 ntTSL 54.62□□□□□ -1.674e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-210ENST00000479121 430 ntTSL 54.56□□□□□ -1.684e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-205ENST00000464360 585 ntTSL 33.96□□□□□ -1.784e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.84e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.924e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-206ENST00000461830 2131 ntTSL 55.99□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 RFWD2-205ENST00000459744 741 ntTSL 33.14□□□□□ -1.912e-7■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-214ENST00000468619 2775 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-217ENST00000498519 510 ntTSL 311.15□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 34.4
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.414e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-206ENST00000504721 477 ntTSL 55.04□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-203ENST00000502562 743 ntTSL 34.83□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 ANAPC10-210ENST00000508087 749 ntTSL 33.6□□□□□ -1.834e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 CLIC2-203ENST00000465553 902 ntTSL 35.07□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 CLIC2-201ENST00000321926 629 ntTSL 33.85□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.851e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 CLIC2-204ENST00000491205 516 ntTSL 22.46□□□□□ -2.021e-6■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.977e-7■■■■■ 34.3
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-204ENST00000504770 813 ntTSL 34.95□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.635e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-207ENST00000549633 1076 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-208ENST00000550173 891 ntTSL 515.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-209ENST00000551506 586 ntTSL 314.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 LINC00630-204ENST00000435966 568 ntTSL 37.64□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 LINC00630-203ENST00000431616 561 ntTSL 57.57□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.057e-7■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-210ENST00000532764 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-208ENST00000532277 889 ntTSL 510.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-205ENST00000528189 482 ntTSL 210.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-209ENST00000532589 331 ntTSL 310.51□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -12e-6■■■■■ 34.2
EXOSC5Q9NQT4 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 34.2
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