Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD93Q9NPY3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD93Q9NPY3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD93Q9NPY3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms