Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PLXNA4Q9HCM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PLXNA4Q9HCM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PLXNA4Q9HCM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms