Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1LQ9HCJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
VAT1LQ9HCJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1LQ9HCJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 393.9 ms