Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG7

GBA2, Non-lysosomal glucosylceramidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBA2Q9HCG7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBA2Q9HCG7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBA2Q9HCG7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBA2Q9HCG7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms