Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC28A3Q9HAS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC28A3Q9HAS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC28A3Q9HAS3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC28A3Q9HAS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms