Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EBF2Q9HAK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EBF2Q9HAK2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EBF2Q9HAK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms