Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG4Q9H9E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COG4Q9H9E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COG4Q9H9E3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COG4Q9H9E3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms