Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCAS3Q9H6U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
BCAS3Q9H6U6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BCAS3Q9H6U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BCAS3Q9H6U6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms