Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF3Q9H4D5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF3Q9H4D5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF3Q9H4D5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF3Q9H4D5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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