Protein–RNA interactions for Protein: Q9H211

CDT1, DNA replication factor Cdt1, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDT1Q9H211 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDT1Q9H211 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDT1Q9H211 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDT1Q9H211 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDT1Q9H211 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDT1Q9H211 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDT1Q9H211 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms