Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1M3

DEFB129, Beta-defensin 129, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB129Q9H1M3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DEFB129Q9H1M3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DEFB129Q9H1M3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DEFB129Q9H1M3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DEFB129Q9H1M3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms