Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E2

XPO4, Exportin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPO4Q9C0E2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPO4Q9C0E2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPO4Q9C0E2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPO4Q9C0E2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms