Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPRY4Q9C004 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPRY4Q9C004 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRY4Q9C004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms