Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPEB1Q9BZB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPEB1Q9BZB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPEB1Q9BZB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms