Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNTNAP3Q9BZ76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP3Q9BZ76 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms