Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC8Q9BY41 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC8Q9BY41 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HDAC8Q9BY41 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms