Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCNM1Q9BWG6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCNM1Q9BWG6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCNM1Q9BWG6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms