Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAIPQ9BWF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAIPQ9BWF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAIPQ9BWF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAIPQ9BWF2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms