Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFT27Q9BW83 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFT27Q9BW83 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms