Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
HIRIP3Q9BW71 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
HIRIP3Q9BW71 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
HIRIP3Q9BW71 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HIRIP3Q9BW71 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms