Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SELENOOQ9BVL4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SELENOOQ9BVL4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SELENOOQ9BVL4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms