Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV38

WDR18, WD repeat-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR18Q9BV38 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR18Q9BV38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR18Q9BV38 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR18Q9BV38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR18Q9BV38 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR18Q9BV38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms