Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN3Q9BTN0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRFN3Q9BTN0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRFN3Q9BTN0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN3Q9BTN0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms