Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCM2Q9BSQ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCM2Q9BSQ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCM2Q9BSQ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms