Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22CQ9BRL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SEC22CQ9BRL7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SEC22CQ9BRL7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms