Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC77Q9BR77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC77Q9BR77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC77Q9BR77 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC77Q9BR77 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms