Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNS3Q9BQ31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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KCNS3Q9BQ31 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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KCNS3Q9BQ31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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KCNS3Q9BQ31 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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KCNS3Q9BQ31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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KCNS3Q9BQ31 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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KCNS3Q9BQ31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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KCNS3Q9BQ31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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KCNS3Q9BQ31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNS3Q9BQ31 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNS3Q9BQ31 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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