Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRX2Q99811 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRRX2Q99811 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRRX2Q99811 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms