Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR4Q99677 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR4Q99677 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR4Q99677 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms