Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CGRRF1Q99675 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGRRF1Q99675 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CGRRF1Q99675 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms