Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDCA3Q99618 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDCA3Q99618 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDCA3Q99618 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms